Repository navigation
Expand file tree
/
Copy pathduckdb_engine.py
More file actions
629 lines (514 loc) · 24.1 KB
/
Copy pathduckdb_engine.py
File metadata and controls
629 lines (514 loc) · 24.1 KB
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
# duckdb_engine.py
"""
Движок для больших данных на DuckDB.
Ключевые принципы для больших файлов (7+ ГБ, 100+ млн строк):
1. НИКОГДА не читать весь файл в RAM.
• проверка кодировки — только первые 64 КБ;
• нормализация хвоста — только последние 8 КБ;
• перекодировка — потоково, chunks по 4 МБ.
2. НЕ создавать временные копии, если файл уже в UTF-8
и не имеет лишних пустых строк в конце.
3. DuckDB view — ленивый, реальное чтение начинается
только при первом SELECT. Регистрация view — мгновенная.
"""
import os
import tempfile
import duckdb
DUCKDB_THRESHOLD = 250 * 1024 * 1024 # 250 МБ
MAX_PRINT_ROWS = 20
MAX_SHOW_ROWS = 1000
# Размеры «быстрых» проверок
ENCODING_SNIFF_BYTES = 64 * 1024 # 64 КБ — для определения кодировки
TRAILING_SNIFF_BYTES = 8 * 1024 # 8 КБ — для проверки хвоста
TRANSCODE_CHUNK_BYTES = 4 * 1024 * 1024 # 4 МБ — для потоковой перекодировки
# ============================================================
# ГЛОБАЛЬНОЕ СОЕДИНЕНИЕ
# ============================================================
# Все DuckDBTable используют ОДНО соединение, чтобы JOIN, UNPIVOT
# и другие операции могли ссылаться на таблицы друг друга по имени.
_GLOBAL_CON = None
def get_global_connection():
"""Возвращает глобальное соединение DuckDB (создаёт при первом вызове)."""
global _GLOBAL_CON
if _GLOBAL_CON is None:
_GLOBAL_CON = duckdb.connect()
return _GLOBAL_CON
def should_use_duckdb(path):
if not os.path.exists(path):
return False
return os.path.getsize(path) >= DUCKDB_THRESHOLD
# ============================================================
# ОПРЕДЕЛЕНИЕ КОДИРОВКИ (только по первым N КБ)
# ============================================================
def _detect_encoding(path):
"""
Определяет кодировку CSV по ПЕРВЫМ 64 КБ.
НЕ читает весь файл. Для 7,9 ГБ — это один seek + read 64 КБ.
Возвращает имя кодировки или 'utf-8' как fallback.
"""
candidates = ['utf-8', 'cp1251', 'utf-16', 'latin-1', 'koi8-r']
try:
with open(path, 'rb') as f:
head = f.read(ENCODING_SNIFF_BYTES)
except Exception:
return 'utf-8'
# BOM-проверки
if head.startswith(b'\xef\xbb\xbf'):
return 'utf-8-sig'
if head.startswith(b'\xff\xfe') or head.startswith(b'\xfe\xff'):
return 'utf-16'
if head.startswith(b'\xff\xfe\x00\x00') or head.startswith(b'\x00\x00\xfe\xff'):
return 'utf-32'
for enc in candidates:
try:
head.decode(enc)
return enc
except (UnicodeDecodeError, LookupError):
continue
return 'utf-8'
def _ensure_utf8(path):
"""
Проверяет, что файл в UTF-8. Если нет — создаёт временную копию
ПОТОКОВО (chunks по 4 МБ), НЕ читая весь файл в RAM.
Возвращает (utf8_path, is_temp).
ВАЖНО:
• UTF-8 и UTF-8 BOM → возвращаем исходный путь, is_temp=False.
BOM DuckDB сам обрабатывает в read_csv_auto.
• Другие кодировки → потоковая перекодировка во временный файл.
"""
encoding = _detect_encoding(path)
if encoding in ('utf-8', 'utf-8-sig'):
return path, False
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(
mode='wb',
suffix='.utf8.csv',
delete=False,
)
try:
with open(path, 'rb') as src:
decoder = None
try:
import codecs
decoder = codecs.getincrementaldecoder(encoding)(errors='replace')
except Exception:
decoder = None
if decoder is None:
# fallback: построчное чтение
with open(path, 'r', encoding=encoding, errors='replace') as sf:
for line in sf:
tmp.write(line.encode('utf-8'))
else:
while True:
chunk = src.read(TRANSCODE_CHUNK_BYTES)
if not chunk:
tail = decoder.decode(b'', final=True)
if tail:
tmp.write(tail.encode('utf-8'))
break
text = decoder.decode(chunk, final=False)
if text:
tmp.write(text.encode('utf-8'))
except Exception as e:
tmp.close()
try:
os.remove(tmp.name)
except Exception:
pass
raise RuntimeError(f"Не удалось перекодировать файл как {encoding}: {e}")
tmp.close()
return tmp.name, True
# ============================================================
# ПРОВЕРКА ХВОСТА ФАЙЛА (только последние 8 КБ)
# ============================================================
def _has_trailing_blank_lines(path):
"""
Быстро проверяет, есть ли в КОНЦЕ файла «лишние» пустые строки
(артефакт CSV-формата).
Читает ТОЛЬКО последние TRAILING_SNIFF_BYTES байт.
Для 7,9 ГБ — это один seek + read 8 КБ.
Возвращает:
• 0 — если в хвосте нет пустых строк (файл нормальный)
• N — сколько байт «лишнего» в конце (можно обрезать)
"""
try:
size = os.path.getsize(path)
except Exception:
return 0
if size == 0:
return 0
tail_size = min(TRAILING_SNIFF_BYTES, size)
try:
with open(path, 'rb') as f:
f.seek(size - tail_size)
tail = f.read()
except Exception:
return 0
# Отрезаем завершающие \r и \n
stripped_len = len(tail.rstrip(b'\r\n'))
trailing_ws_len = len(tail) - stripped_len
# Если в конце 0 или 1 перевод строки — это нормально,
# лишних пустых строк нет.
# Считаем «лишними» только 2+ подряд идущих \n (с учётом \r\n).
# Например: "a,b\n\n" → лишняя одна пустая строка.
# "a,b\n" → норма.
if trailing_ws_len <= 2:
# ≤ 2 байта — это либо "\n", либо "\r\n" — норма
return 0
# Если в хвосте одни \n и \r — значит, там только пустые строки.
# Вернём количество лишних байт, но не больше tail_size.
# (точное число определим при обрезке)
return trailing_ws_len
def _trim_trailing_blank_lines(src_path, dst_file):
"""
Копирует src_path в dst_file, отрезая ЗАВЕРШАЮЩИЕ пустые строки.
Потоково, chunks по 4 МБ. НЕ читает весь файл в RAM.
Возвращает (bytes_written, bytes_trimmed).
"""
try:
size = os.path.getsize(src_path)
except Exception:
size = 0
if size == 0:
return 0, 0
# Найдём, сколько байт надо отрезать с конца.
# Идём с конца блоками по 64 КБ, пока не найдём последний непустой байт.
trim_bytes = 0
block = 64 * 1024
with open(src_path, 'rb') as f:
pos = size
while pos > 0:
step = min(block, pos)
f.seek(pos - step)
chunk = f.read(step)
# Ищем с конца первый байт, не являющийся \r или \n
idx = len(chunk)
while idx > 0 and chunk[idx - 1] in (0x0A, 0x0D):
idx -= 1
if idx == len(chunk):
# В этом блоке нет завершающих \r\n — обрезать нечего
break
# Сколько байт в этом блоке — завершающие \r\n
ws_in_block = len(chunk) - idx
trim_bytes += ws_in_block
if idx > 0:
# Нашли непустой байт в этом блоке — дальше не идём
break
pos -= step
# Оставляем ровно один завершающий \n (если файл не пустой)
# Если trim_bytes > 0, значит, в конце были \r\n — оставляем один \n.
# Если trim_bytes == 0 — ничего не трогаем.
if trim_bytes == 0:
# Нечего обрезать — просто копируем как есть
written = 0
with open(src_path, 'rb') as src, open(dst_file, 'wb') as dst:
while True:
chunk = src.read(TRANSCODE_CHUNK_BYTES)
if not chunk:
break
dst.write(chunk)
written += len(chunk)
return written, 0
# Копируем до (size - trim_bytes), затем добавляем один \n
keep_until = size - trim_bytes
written = 0
with open(src_path, 'rb') as src, open(dst_file, 'wb') as dst:
remaining = keep_until
while remaining > 0:
step = min(TRANSCODE_CHUNK_BYTES, remaining)
chunk = src.read(step)
if not chunk:
break
dst.write(chunk)
written += len(chunk)
remaining -= len(chunk)
# Добавим ровно один \n в конец, чтобы файл не склеивался
# со следующим при конкатенации.
if keep_until > 0:
dst.write(b'\n')
written += 1
return written, trim_bytes
# ============================================================
# DUCKDBTABLE
# ============================================================
class DuckDBTable:
def __init__(self, path, table_name=None, connection=None,
preserve_insertion_order=True, sample_size=20000):
self.path = path
self.table_name = table_name or self._make_table_name(path)
# ============================================================
# ГЛОБАЛЬНОЕ соединение — чтобы все таблицы были видны
# друг другу (JOIN, UNPIVOT).
# ============================================================
self.con = connection or get_global_connection()
self._preserve_insertion_order = preserve_insertion_order
self._sample_size = sample_size
# ============================================================
# ДИАГНОСТИКА — чтобы при отладке было видно, что произошло.
# ============================================================
self._encoding_detected = _detect_encoding(path)
self._was_transcoded = False
self._trailing_trimmed = False
self._trailing_trimmed_bytes = 0
# ============================================================
# ШАГ 1: кодировка.
# Если файл уже UTF-8 — НЕ трогаем его, utf8_path = path.
# Если другая — потоково перекодируем во временный файл.
# ============================================================
self.utf8_path, self.is_temp = _ensure_utf8(path)
self._was_transcoded = self.is_temp
self._tmp_path = self.utf8_path if self.is_temp else None
# ============================================================
# ШАГ 2: нормализация хвоста.
# Быстрая проверка последних 8 КБ. Если в хвосте нет
# «лишних» пустых строк — НИЧЕГО не делаем.
# Если есть — потоково копируем без них во временный файл.
# ============================================================
self._normalize_csv_trailing_newlines()
# ============================================================
# ШАГ 3: регистрация view (ленивая, DuckDB не читает данные).
# ============================================================
self._register()
def _make_table_name(self, path):
base = os.path.basename(path).replace('.', '_').replace(' ', '_')
clean = ''.join(c if c.isalnum() or c == '_' else '_' for c in base)
return f"t_{clean}"
def _detect_delimiter(self):
try:
with open(self.utf8_path, 'r', encoding='utf-8', errors='replace') as f:
first_line = f.readline()
candidates = [',', ';', '\t', '|']
counts = {d: first_line.count(d) for d in candidates}
best = max(counts, key=counts.get)
if counts[best] == 0:
return ','
return best
except Exception:
return ','
# ============================================================
# НОРМАЛИЗАЦИЯ ХВОСТА CSV (только последние 8 КБ)
# ============================================================
def _normalize_csv_trailing_newlines(self):
"""
Отрезает ЗАВЕРШАЮЩИЕ пустые строки, НЕ читая весь файл в RAM.
ЗАЧЕМ:
read_csv_auto с header=true читает завершающую пустую строку
как строку из None по всем столбцам. COUNT(*) её не считает
(ignore_errors=false), а SELECT * возвращает. Из-за этого
get_row_count() и get_data_for_show() дают разное число строк,
и joinarray(horizontal) получает лишнюю None-строку.
КАК:
1. Быстрая проверка: читаем последние 8 КБ.
2. Если лишних пустых строк нет — немедленный возврат.
3. Если есть — потоково копируем без них во временный файл.
"""
# ---- 1. Быстрая проверка хвоста ----
trim_len = _has_trailing_blank_lines(self.utf8_path)
if trim_len == 0:
# Хвост нормальный — НИЧЕГО не делаем.
return
# ---- 2. Медленный путь: потоковое копирование с обрезкой ----
tmp = tempfile.NamedTemporaryFile(
mode='wb', suffix='.norm.csv', delete=False,
)
try:
written, trimmed = _trim_trailing_blank_lines(
self.utf8_path, tmp.name,
)
except Exception:
# Не смогли — оставляем как есть, read_csv_auto сам разберётся
try:
os.remove(tmp.name)
except Exception:
pass
return
tmp.close()
if trimmed == 0:
# Ничего не отрезали — временный файл не нужен
try:
os.remove(tmp.name)
except Exception:
pass
return
# ---- 3. Подменяем путь на новый временный ----
old_tmp = self._tmp_path
self.utf8_path = tmp.name
self._tmp_path = tmp.name
self.is_temp = True
self._trailing_trimmed = True
self._trailing_trimmed_bytes = trimmed
# Удаляем старый временный файл, если был
if old_tmp and old_tmp != tmp.name and os.path.exists(old_tmp):
try:
os.remove(old_tmp)
except Exception:
pass
# ============================================================
# РЕГИСТРАЦИЯ VIEW
# ============================================================
def _register(self):
"""
Регистрирует view на CSV-файл.
ВАЖНО:
sample_size — сколько первых строк прочитать для детекции типов.
По умолчанию 20000, но можно уменьшить.
ignore_errors — false: падать при ошибке парсинга,
а не молча терять строки.
preserve_insertion_order — сохранять порядок строк.
Для очень больших файлов можно отключить
(ускоряет загрузку, но порядок не гарантирован).
View ленивый: DuckDB не читает данные при CREATE VIEW.
Реальное чтение начинается при первом SELECT.
"""
safe_path = self.utf8_path.replace("'", "''").replace("\\", "\\\\")
delimiter = self._detect_delimiter()
if delimiter == '\t':
delim_sql = '\\t'
else:
delim_sql = delimiter
# preserve_insertion_order — сессионная настройка DuckDB.
# Если False — ускоряет загрузку очень больших файлов.
if not self._preserve_insertion_order:
try:
self.con.execute("SET preserve_insertion_order = false")
except Exception:
pass
self.con.execute(f"""
CREATE OR REPLACE VIEW {self.table_name} AS
SELECT * FROM read_csv_auto('{safe_path}',
sample_size={int(self._sample_size)},
ignore_errors=false,
header=true,
delim='{delim_sql}')
""")
# ============================================================
# ПОДСЧЁТ СТРОК
# ============================================================
def _count_data(self):
"""
Количество ДАННЫХ (без заголовка).
Для внутренних нужд движка (LIMIT, превью и т.п.).
"""
return self.con.execute(
f"SELECT COUNT(*) FROM {self.table_name}"
).fetchone()[0]
def get_row_count(self):
"""
Количество строк ВКЛЮЧАЯ ЗАГОЛОВОК.
Согласовано с Matrix: lenrow(m) = 5 для 4 строк данных.
В Matrix data[0] — заголовок, поэтому lenrow = 5.
В DuckDB view содержит только данные, поэтому +1.
"""
return self._count_data() + 1
# ============================================================
# ДОСТУП К ДАННЫМ
# ============================================================
def get_columns(self):
result = self.con.execute(
f"SELECT * FROM {self.table_name} LIMIT 0"
).description
return [col[0] for col in result]
def query(self, sql):
return self.con.execute(sql).fetchall()
def query_to_matrix(self, sql):
from runtime.matrix import MatrExMatrix
rows = self.con.execute(sql).fetchall()
data = [list(row) for row in rows]
return MatrExMatrix(data, True)
def get_data_for_show(self, limit=MAX_SHOW_ROWS):
try:
data = self.query(
f"SELECT * FROM {self.table_name} LIMIT {limit}"
)
return [list(row) for row in data]
except Exception as e:
print(f"DuckDB get_data_for_show error: {e}")
return [[""]]
def get_headers(self):
return self.get_columns()
def get_column_type(self, col_name):
try:
safe_col = '"' + str(col_name).replace('"', '""') + '"'
result = self.con.execute(
f'SELECT typeof({safe_col}) FROM {self.table_name} LIMIT 1'
).fetchone()
return result[0] if result else 'VARCHAR'
except Exception:
return 'VARCHAR'
def close(self):
"""
Закрывает таблицу.
ВАЖНО:
• Глобальное соединение НЕ закрываем — оно общее.
• Удаляем ТОЛЬКО временные файлы, созданные нами.
• Исходный файл пользователя НИКОГДА не удаляем.
"""
try:
if self.con is not None and self.con is not get_global_connection():
self.con.close()
except Exception:
pass
self.con = None
# Удаляем только временный файл, и только если он не совпадает
# с исходным путём пользователя.
if (self._tmp_path
and os.path.exists(self._tmp_path)
and os.path.abspath(self._tmp_path) != os.path.abspath(self.path)):
try:
os.remove(self._tmp_path)
except Exception:
pass
self._tmp_path = None
def __str__(self):
try:
data_rows = self._count_data()
columns = self.get_columns()
cols = len(columns)
preview_rows = min(MAX_PRINT_ROWS, data_rows)
data = self.query(
f"SELECT * FROM {self.table_name} LIMIT {preview_rows}"
)
lines = self._format_table(columns, data)
if data_rows > MAX_PRINT_ROWS:
lines.append(f"... (всего {data_rows} строк × {cols} столбцов)")
else:
lines.append(f"({data_rows} строк × {cols} столбцов)")
return "\n".join(lines)
except Exception as e:
import traceback
return f"DuckDBTable({self.table_name}, ошибка: {e})\n{traceback.format_exc()}"
def _format_table(self, columns, rows):
if not rows:
return ["(пусто)"]
widths = []
for i, col in enumerate(columns):
max_width = len(str(col))
for row in rows:
if i < len(row):
max_width = max(max_width, len(str(row[i])))
widths.append(max_width)
lines = []
header = " ".join(
str(col).ljust(widths[i])
for i, col in enumerate(columns)
)
lines.append(header)
lines.append("-" * len(header))
for row in rows:
line = " ".join(
str(row[i] if i < len(row) else "").ljust(widths[i])
for i in range(len(columns))
)
lines.append(line)
return lines
def __repr__(self):
return self.__str__()
def escape_identifier(name):
return '"' + str(name).replace('"', '""') + '"'
def escape_value(value):
if value is None:
return "NULL"
if isinstance(value, bool):
return "TRUE" if value else "FALSE"
if isinstance(value, (int, float)):
return str(value)
return "'" + str(value).replace("'", "''") + "'"